Starting with his local club SC Freiberg, Philipp Pentke made his way into the acadamies from Dynamo Dresden and 1860 Munich. With Sechzig, he worked his way into the first-team and was a part of the squad from 2005.
After spending time with FC Augsburg and Energie Cottbus, Pentke joined Chemnitzer FC and helped the club to gain promotion to 3. Liga in 2011.
Nach Stationen beim FC Augsburg und Energie Cottbus wechselte er zum Chemnitzer FC, mit dem ihm 2011 als Stammtorhüter der Aufstieg in die 3. Liga gelang. 2015 schloss sich Pentke dem SSV Jahn Regensburg an, stieg 2016 erneut in die 3. Liga und ein Jahr später in die 2. Bundesliga auf. Ab 2019 stand er bei der TSG Hoffenheim unter Vertrag. Am 1. August 2023 verpflichtete der FC den routinierten Keeper als Backup für Marvin Schwäbe. Seine Freizeit verbringt „Penne”, wie er von seinen Teamkollegen genannt wird, am liebsten beim Angeln oder mit seiner Familie und Chihuahua Chico.